Исландия генетично подрежда всеки случай на COVID-19 във водеща в света стратегия

(NIAID/Wikimedia Commons/CC BY 2.0)

Исландия е генетично секвенирала всичките си положителни неща COVID-19 случаи от началото на пандемия , все по-важна практика, тъй като тревожни нови щамове се появяват от Великобритания и Южна Африка.

The Световна здравна организация в петък призова всички страни да ускорят секвенирането на генома, за да помогнат в борбата с нововъзникващите варианти.

Учените от лабораторията на исландската биофармацевтична група deCODE Genetics в Рейкявик са работили неуморно през последните 10 месеца, анализирайки всеки положителен резултаттест за коронавирусв Исландия по искане на здравните власти на страната.

Целта е да се проследи всеки случай, за да не се промъкнат проблемни в мрежата.

„Отнема ни относително кратко време, за да направим действителното секвениране“, обяснява ръководителят на лабораторията Олафур Тор Магнусон, добавяйки, че „около три часа“ е всичко, което е необходимо, за да се определи вирус щам.

Целият процес, от изолирането на ДНК до нейното секвениране, може да отнеме до ден и половина и е позволил на Исландия да идентифицира 463 отделни варианта – които учените наричат ​​хаплотипове.

Преди секвениране, ДНК на всяка проба първо се изолира, след което се пречиства с помощта на магнитни перли.

След това пробите се отвеждат в масивна, светла стая, пълна с оборудване, където се излъчва оглушителен звук от малки машини, наподобяващи скенери.

Машините са генни секвенсори, които картографират романа коронавирус геном.

Световен лидер

Във всяка машина има черна кутия, наречена „поточна клетка“, предметно стъкло, което съдържа ДНК молекулите.

Тази технология изигра голяма роля в Исландия от началото на пандемията.

„Секвенцията на пробите е ключова, за да ни помогне да проследим състоянието и развитието на епидемия “, каза министърът на здравеопазването Свандис Сваварсдотир пред АФП.

Властите са използвали информацията за последователността, за да вземат решение за точни, целеви мерки за ограничаване на разпространението на вируса, каза тя.

Докато южноафриканският вариант не е открит в Исландия, 41 души са идентифицирани като носители на британския вариант.

Всички те бяха спрени на границата – където се провеждат PCR тестове на пътниците – ефективно предотвратявайки предаването на варианта на субарктическия остров.

ДНК идентификацията също така позволи да се установи ясна връзка между посетителите на пъб в центъра на Рейкявик и по-голямата част от инфекциите в новата вълна в средата на септември – накара властите да затворят барове и нощни клубове в столицата.

Секвенирането също така идентифицира отделен щам от двама френски туристи, които са дали положителен тест при пристигането си в Исландия и които първоначално бяха обвинени – погрешка – като причина за септемврийския скок.

Всичките около 6000 случая на COVID-19, докладвани в Исландия, са секвенирани, което я прави световен лидер в секвенирането на COVID.

Докато няколко страни, като Великобритания, Дания, Австралия и Нова Зеландия, извършват високи нива на секвениране, нито една от тях не се доближава до нивата на Исландия, въпреки че глобалните статистики са непълни.

Детска игра

Така че защо Исландия е толкова напред в играта?

Генното картографиране е специалността на deCODE.

Основана през 1996 г., компанията е извършила най-голямото досега генетично изследване на популация.

За проучване от 2015 г рак рискови фактори, той секвенира целия геном на 2500 исландци и изследва генетичния профил на една трета от тогавашното население от 330 000 души.

В сравнение с това секвенирането на проби от COVID-19 е детска игра.

„Много е лесно да се секвенира този вирусен геном: това са само 30 000 нуклеотида, това е нищо“, шегува се Кари Стефансон, 71-годишният основател и главен изпълнителен директор на компанията.

За сравнение, човешкият геном, който обикновено се анализира в неговите лаборатории, се състои от 3,4 милиарда двойки нуклеотиди или органични молекули, добавя той.

Въпреки че строгото секвениране на Исландия е полезно за проследяване на разпространението на вируса, то все още не е довело до големи научни открития за deCODE.

„Ако има разлики между вируси с различните мутации на модели те не са много очевидни. Не е достатъчно очевидно, за да го вземем“, казва Стефансон.

©Медийна агенция Франция

За Нас

Публикуването На Независими, Доказани Факти От Доклади За Здравето, Пространството, Природата, Технологиите И Околната Среда.